アイオン RMTギルドバトルでは，各プレイヤーがBP（バトルポイント）を消費して敵ギルドのプレイヤーへと攻撃を行い，30分の制限時間内で，より多くのポイントを稼いだ側の勝ちとなる。また，敵プレイヤー全員の体力が0になった「全滅」状態に3回追い込むか，相手を全滅状態で3分経過させることでも勝利となる。
敵からの攻撃を受ける前衛の5人と，敵から直接は攻撃されない後衛の5人で，攻撃のみならず，自分や他のプレイヤーの体力を回復したり，復活させたりすることができる「CURE」（使用回数制限あり）を，どのタイミングで使うかなど，リアルタイムで連携していかないと勝利は遠い
このギルドバトルのみならず，敵陣営のプレイヤーと個別に強力なモンスターカードを手に入れる鍵となる「聖宝」を賭けて対戦する際にも重要になるのが，プレイヤーが組む自分のパーティ。
5体のモンスターと，それぞれに騎乗する5人のウォリアーを選び，自分だけのオリジナルパーティを結成することができる。
ここで単に強いモンスターを選べばいいというワケではないのが，本作の「ダブルデッキシステム」の魅力だ。
各モンスターの攻撃力や守備力に，ウォリアーの能力を上乗せし，さらに組み合わせなどで生じるボーナスを足したものがモンスターの最終的な能力となる。そのため，ウォリアーの選択によってモンスターの長所を伸ばしたり，短所を補ったりすることが可能だ。
さらにウォリアーカードとモンスターカードは，ほかの不要な同種のカードと所持金を消費することで「強化」でき，さらに強くなっていく。また，一部のカードを除いて同じカードが2枚揃えば，それを掛け合わせることで1段階上のカードへと「進化」させることも可能だ。
この進化を使いこなせば，高レアリティのカードがなかなか手に入らないという人も，HRやSRといった高レアリティのカードを早い段階で手に入れられるので，ぜひ活用してほしい。とくに聖宝で手に入るカードは，最終段階に達するまで繰り返し入手して進化させられるので，まずはこれらの習得を目指して聖宝を集めるのがオススメだ。